MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015184	ATCC	2	8	323073	323080	25 %	25 %	0 %	50 %	325168650
5502	NC_015184	TGG	2	6	323085	323090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168650
5503	NC_015184	GAT	2	6	323113	323118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168650
5504	NC_015184	GCA	2	6	323198	323203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5505	NC_015184	CGA	2	6	323295	323300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5506	NC_015184	TCGCT	2	10	323504	323513	0 %	40 %	20 %	40 %	325168650
5507	NC_015184	TTG	2	6	323577	323582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168650
5508	NC_015184	TGG	2	6	323684	323689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168650
5509	NC_015184	TGG	2	6	323712	323717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168650
5510	NC_015184	CTC	2	6	323728	323733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168650
5511	NC_015184	TCC	2	6	323745	323750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168650
5512	NC_015184	CAGGG	2	10	323783	323792	20 %	0 %	60 %	20 %	325168650
5513	NC_015184	CCT	2	6	323818	323823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168650
5514	NC_015184	GGC	2	6	323830	323835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168650
5515	NC_015184	GC	3	6	323865	323870	0 %	0 %	50 %	50 %	325168650
5516	NC_015184	TGC	2	6	323874	323879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5517	NC_015184	GCG	2	6	323883	323888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168650
5518	NC_015184	CTT	2	6	323921	323926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168650
5519	NC_015184	TGC	2	6	323932	323937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5520	NC_015184	TTC	2	6	323943	323948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168650
5521	NC_015184	TGC	2	6	324069	324074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5522	NC_015184	CAC	2	6	324224	324229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168650
5523	NC_015184	ATC	2	6	324512	324517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168650
5524	NC_015184	AGG	2	6	324591	324596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168650
5525	NC_015184	CTG	2	6	324681	324686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5526	NC_015184	GC	3	6	324717	324722	0 %	0 %	50 %	50 %	325168650
5527	NC_015184	CGCT	2	8	324777	324784	0 %	25 %	25 %	50 %	325168650
5528	NC_015184	TCG	2	6	324829	324834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168650
5529	NC_015184	CATT	2	8	324888	324895	25 %	50 %	0 %	25 %	325168650
5530	NC_015184	GCC	2	6	324896	324901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168650
5531	NC_015184	ATC	2	6	324941	324946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168650
5532	NC_015184	TTG	2	6	325014	325019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168650
5533	NC_015184	CGC	2	6	325027	325032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168650
5534	NC_015184	CAT	2	6	325033	325038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168650
5535	NC_015184	GCCG	2	8	325078	325085	0 %	0 %	50 %	50 %	325168650
5536	NC_015184	TCT	2	6	325087	325092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168650
5537	NC_015184	TCC	2	6	325123	325128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168651
5538	NC_015184	AGGGC	2	10	325172	325181	20 %	0 %	60 %	20 %	325168651
5539	NC_015184	GTG	2	6	325286	325291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168651
5540	NC_015184	GAC	2	6	325427	325432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168651
5541	NC_015184	GCC	2	6	325438	325443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168651
5542	NC_015184	GAC	2	6	325560	325565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168651
5543	NC_015184	CAAG	2	8	325686	325693	50 %	0 %	25 %	25 %	325168651
5544	NC_015184	TAT	2	6	325695	325700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168651
5545	NC_015184	TCTT	2	8	325735	325742	0 %	75 %	0 %	25 %	325168651
5546	NC_015184	GTC	2	6	325793	325798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168651
5547	NC_015184	GAC	2	6	325887	325892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168651
5548	NC_015184	CCG	2	6	325924	325929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168651
5549	NC_015184	GAC	2	6	325956	325961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168651
5550	NC_015184	TGA	2	6	326287	326292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168652
5551	NC_015184	GTG	2	6	326579	326584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168653
5552	NC_015184	CTC	2	6	326590	326595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168653
5553	NC_015184	T	6	6	326610	326615	0 %	100 %	0 %	0 %	325168653
5554	NC_015184	TCG	2	6	326726	326731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168653
5555	NC_015184	GC	3	6	326747	326752	0 %	0 %	50 %	50 %	325168653
5556	NC_015184	AGG	2	6	326864	326869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168653
5557	NC_015184	GT	3	6	326921	326926	0 %	50 %	50 %	0 %	325168653
5558	NC_015184	CGATA	2	10	327046	327055	40 %	20 %	20 %	20 %	325168653
5559	NC_015184	AGA	2	6	327134	327139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168653
5560	NC_015184	TCA	2	6	327150	327155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168653
5561	NC_015184	GCAA	2	8	327158	327165	50 %	0 %	25 %	25 %	325168653
5562	NC_015184	GC	3	6	327171	327176	0 %	0 %	50 %	50 %	325168653
5563	NC_015184	CGG	2	6	327210	327215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168653
5564	NC_015184	CGA	2	6	327298	327303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168653
5565	NC_015184	TTG	2	6	327304	327309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168653
5566	NC_015184	GAT	2	6	327411	327416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5567	NC_015184	A	6	6	327423	327428	100 %	0 %	0 %	0 %	325168654
5568	NC_015184	GCG	2	6	327430	327435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168654
5569	NC_015184	TGCC	2	8	327447	327454	0 %	25 %	25 %	50 %	325168654
5570	NC_015184	GCTG	2	8	327467	327474	0 %	25 %	50 %	25 %	325168654
5571	NC_015184	GAT	2	6	327522	327527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5572	NC_015184	CAG	2	6	327581	327586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5573	NC_015184	GCC	2	6	327608	327613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168654
5574	NC_015184	TGC	2	6	327615	327620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5575	NC_015184	TGG	2	6	327662	327667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168654
5576	NC_015184	TGA	2	6	327692	327697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5577	NC_015184	GGA	2	6	327774	327779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168654
5578	NC_015184	ACC	2	6	327817	327822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168654
5579	NC_015184	AGC	2	6	327845	327850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5580	NC_015184	GAT	2	6	327897	327902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5581	NC_015184	GGC	2	6	327912	327917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168654
5582	NC_015184	GAT	2	6	327942	327947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5583	NC_015184	GAA	2	6	328003	328008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168654
5584	NC_015184	CCG	2	6	328019	328024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168654
5585	NC_015184	GGT	2	6	328035	328040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168654
5586	NC_015184	GTCG	2	8	328123	328130	0 %	25 %	50 %	25 %	325168654
5587	NC_015184	CTG	2	6	328132	328137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5588	NC_015184	CGA	2	6	328154	328159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5589	NC_015184	TGG	2	6	328182	328187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168654
5590	NC_015184	TGA	2	6	328209	328214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168654
5591	NC_015184	ACG	2	6	328319	328324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168654
5592	NC_015184	GTT	2	6	328444	328449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168654
5593	NC_015184	GAG	2	6	328567	328572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168654
5594	NC_015184	CGCTC	2	10	328587	328596	0 %	20 %	20 %	60 %	325168654
5595	NC_015184	TTCGG	2	10	328598	328607	0 %	40 %	40 %	20 %	325168654
5596	NC_015184	GGC	2	6	328656	328661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168654
5597	NC_015184	CCG	2	6	328683	328688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168654
5598	NC_015184	TGG	2	6	328724	328729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168654
5599	NC_015184	GA	3	6	328960	328965	50 %	0 %	50 %	0 %	325168655
5600	NC_015184	GC	3	6	328986	328991	0 %	0 %	50 %	50 %	325168655
5601	NC_015184	GCT	2	6	328997	329002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168655
5602	NC_015184	TCA	2	6	329020	329025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168655
5603	NC_015184	GGCC	2	8	329027	329034	0 %	0 %	50 %	50 %	325168655
5604	NC_015184	ATC	2	6	329346	329351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168655
5605	NC_015184	ACC	2	6	329364	329369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168655
5606	NC_015184	TTC	2	6	329410	329415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168655
5607	NC_015184	AAG	2	6	329514	329519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168655
5608	NC_015184	GC	3	6	329541	329546	0 %	0 %	50 %	50 %	325168655
5609	NC_015184	GCT	2	6	329558	329563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168655
5610	NC_015184	CGC	2	6	329579	329584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168655
5611	NC_015184	GCC	2	6	329673	329678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168655
5612	NC_015184	GGC	2	6	329703	329708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168655
5613	NC_015184	CGTT	2	8	329857	329864	0 %	50 %	25 %	25 %	325168655
5614	NC_015184	GCG	2	6	329893	329898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168655
5615	NC_015184	ACA	2	6	329932	329937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168655
5616	NC_015184	AAT	2	6	329988	329993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168655
5617	NC_015184	TGCGCT	2	12	330017	330028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168655
5618	NC_015184	ACA	2	6	330148	330153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168656
5619	NC_015184	CCGTT	2	10	330193	330202	0 %	40 %	20 %	40 %	325168656
5620	NC_015184	CGG	2	6	330242	330247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168656
5621	NC_015184	GGC	2	6	330288	330293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168656
5622	NC_015184	TGT	2	6	330386	330391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168656
5623	NC_015184	GGC	3	9	330504	330512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168656
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5734	NC_015184	CGTC	2	8	338142	338149	0 %	25 %	25 %	50 %	325168663
5735	NC_015184	C	6	6	338159	338164	0 %	0 %	0 %	100 %	325168663
5736	NC_015184	GTCC	2	8	338196	338203	0 %	25 %	25 %	50 %	325168663
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5740	NC_015184	AGCTC	2	10	338304	338313	20 %	20 %	20 %	40 %	325168663
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5742	NC_015184	TGAA	2	8	338373	338380	50 %	25 %	25 %	0 %	325168663
5743	NC_015184	ACG	2	6	338423	338428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168664
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5748	NC_015184	GATC	2	8	338723	338730	25 %	25 %	25 %	25 %	325168664
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5857	NC_015184	ACGG	2	8	344658	344665	25 %	0 %	50 %	25 %	325168671
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5863	NC_015184	TTG	2	6	344853	344858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168671
5864	NC_015184	GCT	2	6	344871	344876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168671
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5965	NC_015184	CGATG	2	10	351102	351111	20 %	20 %	40 %	20 %	325168683
5966	NC_015184	GAC	2	6	351112	351117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168683
5967	NC_015184	GC	3	6	351247	351252	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5968	NC_015184	TGG	2	6	351277	351282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168683
5969	NC_015184	CG	4	8	351310	351317	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5970	NC_015184	GAA	2	6	351336	351341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168683
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5977	NC_015184	CGC	2	6	351609	351614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168683
5978	NC_015184	ACCT	2	8	351622	351629	25 %	25 %	0 %	50 %	325168683
5979	NC_015184	GAA	2	6	351636	351641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168683
5980	NC_015184	GC	3	6	351709	351714	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5981	NC_015184	ACTG	2	8	351750	351757	25 %	25 %	25 %	25 %	325168683
5982	NC_015184	CAA	2	6	351849	351854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168683
5983	NC_015184	CCG	2	6	351885	351890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168683
5984	NC_015184	GAG	2	6	351895	351900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168683
5985	NC_015184	CGG	2	6	351960	351965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168683
5986	NC_015184	GAT	2	6	352062	352067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168683
5987	NC_015184	GCC	2	6	352073	352078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168683
5988	NC_015184	ATC	3	9	352081	352089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168683
5989	NC_015184	CGA	2	6	352095	352100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168683
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5991	NC_015184	CG	3	6	352205	352210	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5992	NC_015184	ATC	2	6	352240	352245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168683
5993	NC_015184	CG	3	6	352280	352285	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5994	NC_015184	GC	3	6	352345	352350	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5995	NC_015184	ACA	2	6	352394	352399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168683
5996	NC_015184	CGT	2	6	352401	352406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168683
5997	NC_015184	CCGG	2	8	352454	352461	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5998	NC_015184	CG	3	6	352492	352497	0 %	0 %	50 %	50 %	325168683
5999	NC_015184	GAC	2	6	352507	352512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168683
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